馮飛看向了醍醐冬基：“醍醐大人，你知道自己是什麼身份嗎？身為一個外臣卻打算決定天皇廢立？”這句話堵得醍醐冬基啞口無言，他很想找個盟友一起斥責馮飛，但看看旁邊的兩位親王和諸多大臣，卻全都低垂著頭。醍醐冬基頓時明白了過來，失去了鷹司房輔的支援，他早已是獨木難支，根本無力挽回局面了。
這時候天英院開口了：“我成為天皇之後，要立刻出兵鎮壓叛逆，將殺害識仁天皇的所有人統統除掉。”
這句話出口，大臣們算是找到了個臺階，全都跪倒在地請天皇登基了。醍醐冬基知道大勢已去，狂笑著離開了大殿，卻沒有人再去理睬他了。這位識仁天皇的親信近臣不願看到日本被新漢掌控的結局，當晚便在家中切腹自殺了。
在兩位親王和眾多大臣的擁護下，天英院兩天後登上了天皇寶座，改年號為崇華，同時為識仁天皇選定諡號靈元，宣佈全國舉哀為靈元天皇治喪。
天英院天皇登基之後的第一個諭旨，便是為靈元天皇復仇。鷹司房輔和鷹司房子被以串謀幕府謀害天皇的名義車裂於市，隨後她宣佈剝奪幕府第四代德川家綱的徵夷大將軍之位，將其授予了入京勤王有功的馮飛。
天英院親自為馮飛元服，賜名北條光正，算是暫時成為了日本人，從而掌控了整個日本的最高軍權。有了這一層保證，天英院天皇將三十多萬天皇新軍的兵權都交給了馮飛，命令他除掉刺殺天皇的幕後真兇，平定國內戰亂。
馮飛當即走馬上任，宣佈開始平叛之戰。許多新漢軍的中級軍官紛紛改為日本名字，加入到天皇新軍掌握了真正的指揮權，將原本作為招牌的首領們，那些朱舜水的弟子全都架空了。
這些人本就心慕華夏，否則也不可能成為朱舜水的弟子，他們都是學習儒學的，根本不懂帶兵打仗，如此的作為也算是讓他們松了口氣。
在全面掌控軍權之後，馮飛指揮三十萬天皇親軍多路出擊，開始橫掃四大軍閥的勢力範圍。四大軍閥征戰多年，治下早已經民生凋敝，又如何能阻擋訓練有素士氣高昂，同時有著武器優勢的天皇新軍。
島津綱貴連忙派人前往屋久島尋求幫助，結果卻被告知此地早已經被陸戰隊佔領，假扮清國商人的中書舍人甄銘不知所蹤。德川家綱也遇到了同樣的問題，陳繩武以新漢帝國不會資助日本叛軍為名，根本不再給他提供火器。
缺少武器和資金的四大軍閥節節敗退，很快交出了大量地盤。馮飛僅僅花費了兩個月時間，就打到了江戶城下。德川家綱不得不出城投降，德川幕府自此宣告滅亡。
然而四大軍閥中第一個滅亡的卻不是德川幕府，而是尹達家執掌的北方軍閥。在他們派重兵前往南方作戰，抵擋天皇新軍的時候，新漢帝國陸戰隊第四旅就在顧敏行的率領下越過冰火府與本州島之間的輕津海峽，一舉攻佔了其老巢。
隨著日本兩大軍閥的覆滅，僅剩下的薩摩藩和西南軍閥只能各自守著九州島和四國島苟延殘喘，希望依靠海峽的阻隔，擋住對方的進攻了。
然而他們的奢望註定無法實現，因為在天英院天皇的邀請下，新漢軍北方艦隊介入日本內戰。藍理提督親自率領艦隊和大批運輸船，將五萬天皇新軍運到了九州島。經過一個月的激烈戰鬥，薩摩藩最終被消滅，土左藩為主的西南軍閥見到大勢已去也宣告投降。
依靠著新漢軍和天皇新軍的全力打擊，日本竟是第一次完成了真正意義上的全國統一，將所有權力集中到天皇手中。這似乎提前兩百年完成了明治維新的倒幕運動，不過後世那些明治維新志士若知道此事，也不知是該哭還是該笑了。
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在掌控了全國政權之後，天英院天皇下達了新的清算詔書。所有仇視華夏和同情四大軍閥的人，都被冠以刺殺天皇同謀或者反叛的罪名被斬殺，一時間日本國內掀起了血雨腥風，導致武士階層人人自危。
不過這與平民沒有多少關係，在清理了大部分武士階層之後，天英院天皇下達了改革國家的諭令。日本將在全國開辦新式學校，但這些學校只教授華夏文字，宣傳華日友好和效忠天皇。天英院此舉等於是廢止了日文，但這些與底層百姓沒有多少關係，他們本就不識字，學華夏文字也沒太大問題，只是說話的口音難免要混亂許多年了。
學校除了學習華夏文字之外，將男女分別教學，女子大多學習農耕、養蠶、紡織等技巧，男子則進行軍事化學習，準備未來成為華夏的僱傭兵來源地。除此之外，日本所有礦場資源全都轉入了皇家財團旗下，對外貿易由新漢商人掌控，就連地方治理也被華夏插手，其中絕大多數官員都成了親華派。
經過劉磊多年的暗中準備，馮飛在半年之內就掌控了整個日本，雖然它還處於休養生息階段，但只要假以時日，這個國家必然成為新漢帝國的有力幫手。當宣佈了這份幾乎等於亡國的詔令之後，天英院根本不理那些大臣們的表情，直接回到了後宮裡，此時正有兩個年紀相彷的孩子在那裡等候，他們正是新漢帝國長公主倩兒和她的未婚夫，長皇子衛隊長洪文定。
倩兒與天英院同歲，卻比她大了兩個月，天英院回到後宮，立刻跑上去拉住了她的手：“倩兒姐姐，你覺得我這麼做，夫君會開心嗎？”
“當然，父皇對你是很愛護的，你現在這麼幫父皇，他當然開心了。”倩兒笑了起來，自從三年前天英院被接到福州以後，舉目無親的她就與年齡相彷的倩兒成了好閨蜜，兩人甚至到了無話不談的地步。
向來崇拜劉磊的倩兒自然也把天英院變成了狂熱粉絲，一個九歲的孩子懂什麼？在倩兒的灌輸下，她早就忘記了自己日本人的身份，轉而一心為了劉磊這個自己未來的夫君做事，也才有了此次的女天皇繼位事件。