這一日，人皇繼任大典，陳都廣場之上，人山人海，熱鬧非凡。
一聲鐘響，神農拉著軒轅出現在眾人眼前，眾人頓時安靜了下來，靜靜地等待著神農說話。神農卻並不急著傳位，而是站在高臺下等待了起來，有了上次伏羲傳位的經驗，眾人都知道神農在等待太清的法旨，是以也都陪著等待起來。
片刻後，只見自三十三天之上飛來一輛九龍御輦，御輦上正端坐著天皇伏羲，他的左手邊正站立著人教弟子玄都師。
御輦穩穩地停在了眾人眼前，眾人見是伏羲親來，紛紛拜倒山呼不已。神農領著眾人上前拜過伏羲，笑道：“今日神農證道，皇兄能來真是神農之幸也！”
伏羲呵呵笑道：“這些年來倒是有勞皇弟了，如今皇弟證道真是可喜可賀啊！”
兩人一番寒暄，便見虛空之中，一個身形顯化，手持六根清淨竹，卻是那方丈仙境，無歸道人，眼看無歸道人出現，眾人紛紛跪地下拜，口稱聖師之名，便是伏羲神農，都是連忙上前，躬身一拜。
無歸道人見狀，受了神農一禮，卻是避開伏羲那一拜，說道：“伏羲道友切莫如此，徒兒，今日你功德圓滿，貧道卻來送你一送。”隨即轉首對身邊的玄都師道：“玄都師侄請宣讀老子師兄法旨吧！”
玄都大法師聞言躬身向無歸道人行了個弟子之禮，然後從袖中取出太清符詔，展了開來，神農見狀忙領著眾人拜倒於地，恭聽太清法旨。
只見玄都大法師念道：“太清太上道德天尊敕令：人族共主姜氏神農，自成為人皇以來治天下，務利之已矣，不望其報；不貪天下之財，而天下共富之；不以其智慧自貴於人，而天下共尊之。今可得道，飛昇火雲宮，當歷無量量劫不滅！另著人族公孫軒轅繼位。欽此！”
神農氏退位，天降巨大的功德，不過這次功德之大出乎了眾聖的意料，差不多有伏羲所得功德的兩倍之多，由此可見神農氏為人族付出了多少的汗水。功德大部份進入了神農體內，一小份則飛到無歸道人身前，被無歸道人一揮袖袍，收入懷中，還有一小部分落入了崆峒印當中。
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功德入體後神農氏的修為瞬間提長到了準聖大圓滿，成就了人皇道果。身上一道龍氣衝出，與那崆峒印相合，無歸道人頓時感覺，那崆峒印與人族氣運越發融合起來。
隨即神農取出崆峒印將之交與公孫軒轅，學著當年伏羲的口氣又向眾人道：“此印乃先天至寶崆峒印，鎮壓人族氣運，自人族首領之信物，以後此物便為人皇掌管，今爾執之，當好生教化人族，切記！！”
公孫軒轅連連點頭道：“絕不敢忘！”
軒轅繼位人皇，將原來的風充部落正式更名為有熊部落。元始天尊在軒轅繼位人皇后是眉開眼笑，十分高興，將門下弟子全數派到軒轅身邊，幫助軒轅治理天下。於是，闡教藉著人皇的優勢，逐漸在人族興盛起來。
卻說軒轅繼位，在廣成子的鼓動下，一心想建立豐功偉業，希望自己的功績能夠不弱伏羲神農二位人皇，於是在廣成子的鼓動下，他便下令人族各個部落強兵練武，如有不從他則以強硬的手段迫使對方服從自己的命令。
人族各個部落雖然對軒轅這番舉動頗有微詞，但卻不可否認，軒轅的這一番舉動促使了人族的大融合，使人族的勢力大增。
然而，這樣的行為，卻是給了其心有異的九黎部落一個藉口，言及人皇無道，罔顧眾部落的信任，卻是率兵攻打軒轅部落。
卻說這蚩尤，乃是巫族十三祖巫蚩尤轉世。可能因為身懷巫族血脈，並且極其親近巫族的緣故，蚩尤出生不久後血脈就覺醒了，而且也記起了前世的種種，蚩尤發現現在乃是人族為主角，知道巫妖二族大概都失敗了，心中傷心不已，不過他知道憑藉現在的巫族是不可能恢復昔日榮光的，不說現在巫族式微，不能和現在的人族相抗衡，就算能，那些聖人和大神通者也是不會允許的，最後大概只能落一個族滅的下場。
何況現在自己也不是是純粹的巫族了，不過蚩尤還是不想放棄恢復巫族昔日榮光的想法，至少也要巫族能夠和人族一樣正大光明的生活在這天地之間，而不是如現在那樣蝸居於祖巫殿或幽冥地獄之中，因此蚩尤想到了一個方法，自己雖然有巫族血脈但也有人族血脈，如果自己能夠成為人皇，那麼就可以以人皇的名義重興巫族，恢復巫族昔日的榮耀，和人族一起自由自在的生存在這片天地之間，這樣不但是在聖人可以的接受範圍之內，不會為巫族帶來災難，而且自己也可以成就人皇果位，如聖人一般不死不滅，得享永恆。
因此，蚩尤成為部落首領之後，便大力發展實力，眼看軒轅剛剛繼位，根基不穩，也沒有得到一眾人族的認可，自己想要成為人皇，那就只有將軒轅從人皇之位拉下來，因此，蚩尤立刻整合九黎部落的實力。以巫族秘法開始訓練族中勇士，隨後憑藉實力統一了九黎部落，將九個部落合併成了一個大部落九黎部落，一統九黎後，蚩尤將部落劃分為八十一個部分，又從中挑出族中實力強大的八十一個族人於之結為兄弟，每個兄弟管理一個部分。這八十一個族人都覺醒了巫族血脈，蚩尤又將巫族神通傳給這些兄弟，眾兄弟紛紛神通大增，都達到了小巫境界。
如此一來，蚩尤可謂是兵強馬壯，直接出兵攻擊軒轅，自人族大興一來，攻打人皇的事情還是都一次，軒轅沒有想到蚩尤竟然會搶先出兵，一時間被打了個措手不急，損失慘重。如果不是有廣成子和一眾闡教金仙相助，恐怕只此一戰他就會丟掉人皇之位。